2002年《X档案》六年后,前联邦特工达纳·斯考利(吉莲·安德森·吉莲·安德森饰)被调到一家教会医院当医生,而福克斯·穆德(大卫·杜楚尼·大卫·杜楚尼饰)则隐居起来,继续关注超自然现象。 一天,联邦调查局的特工来寻求他们的帮助。 一段时间以来,几名妇女在弗吉尼亚神秘失踪,其中包括一名联邦特工。 约瑟夫神父(比利·康诺利)声称看到了犯罪现场,联邦调查局希望在超自然案件方面经验丰富的莫特和史高丽能协助调查。 然而,随着调查的深入,穆德和史高丽发现,案件的黑暗远远超出了他们的想象。 这对共事多年的搭档正面临着巨大的考验...