距离《琼斯博士在印第安纳》的最后一部冒险故事已经过去了19年。时过境迁,大银幕上的虚构故事与现实同步——印第安纳在他任教的马歇尔大学度过了19年,却被迫面对政府的压力,有被大学开除的危险...1957年是冷战高峰,印第安纳面对的敌人也从德国纳粹变成了苏联特工。 经过一番莫名其妙的追捕,印第安纳遇到了一个叫马特·威廉姆斯的年轻人,一个喜欢穿皮夹克、标准朋克风格的骑行党。 当他知道了印第安纳的身份后,就让他和自己一起去秘鲁森林里的古代墓地,寻找一个叫水晶头骨的神器,据说是外星人留下的,有强大的控制人的思想的功能。 还有一群人也在想尽办法得到水晶头骨。她们是以苏联女特工伊琳娜·斯帕可为首的精英部队。伊琳娜虽然是个女的,但却是个死钢的人。光看她的头发就能看出她有多细致严谨。不然她怎么会成为克格勃的头目?邪恶的考古学家迈克和印第安纳的旧爱马里恩·拉文伍德加入了这场混乱的战斗...水晶头骨最终落入谁的手中,可能会影响冷战的大局,以及两国的命运。